Der Fluss Blanice ist der rechte Nebenfluss des Flusses Otava, in den er nicht weit von der Gemeinde Putim, etwa 5 km südlich von Písek mündet. Er entspringt am nördlichen Abhang des Bergs Knížecí Stolec (1.226 m), in der 960 m Seehöhe, etwa 15 km südwestlich von Volary.

Sein Oberlauf fließt durch hügelige Landschaft mit zahlreichen tief eingeschnittenen Canyontälern. Eines der schönsten Canyontäler blieb unter der Burgruine Hus erhalten. Das Naturreservat Horní Blanice wurde zum Schutz des Flusses und seiner Umgebung im Abschnitt zwischen Arnoštov und der Mühle Blanický mlýn erklärt.
Der Bach Cikánský potok mündet in ihn nicht weit von Záblatí. Bei Husinec wurde der Flusslauf durch den Staudamm des Stausees Husinec abgedämmt. Der hinter dem Staudamm entstandene Stausee dient als Wasserreservoir für Prachatice.
Am Mittellauf wird der Fluss flacher und das Tal des Flusses breitet sich aus. Der Fluss fließt durch Strunkovice nad Blanicí und durch Bavorov. Der Unterlauf fließt durch schon ganz offene Landschaft bis zum Zusammenfluss mit dem Fluss Otava. Die Städte Vodňany und Protivín sind bedeutende Orte an seinem Unterlauf.

Der Fluss Blanice hat starkes Flussgefälle und ist in der Frühlingszeit wasserreich. In der Vergangenheit wurde der Fluss zur Blockholzverflössung aus den Gebieten der ausgedehnten Wälder in der Umgebung von Volary genutzt. Im Fluss wurde Gold gewaschen. Die Flussperlmuscheln wurden hier gefangen. Der Fluss Blanice ist 95 km lang und entwässert ein Gebiet von 860,5 Quadratkilometern.

Den Zugang zu einzelnen Teilen des Oberlaufs ermöglichen die Trassen der roten (Volary – Zbytiny – Lhenice), der grünen (Volary – Arnoštov – Prachatice) oder der blauen touristischen Markierung (Volary – Křišťanovice – Chroboly). Die Trasse der gelben touristischen Markierung führt entlang des Flusses im Abschnitt zwischen Záblatí und Husinec.